Отдел гражданской обороны, чрезвычайных ситуаций и охраны труда создан в университете приказом ректора в 2002 году. В его состав вошли начальник отдела – начальник штаба ГОЧС университета, инженер по пожарной безопасности, ведущий специалист по охране труда. В своей повседневной деятельности отдел руководствуется Федеральными законами РФ, постановлениями Правительства России, приказами и распоряжениями МЧС РФ по вопросам организации гражданской обороны, защиты населения и территорий от чрезвычайных ситуаций, подготовки органов ГО, сил и средств нештатных аварийно-спасательных формирований (НАСФ), обучения сотрудников и студентов университета в области ГО и защиты от ЧС природного и техногенного характера.
    В отделе отработано Положение о штабе гражданской обороны университета и функциональные обязанности должностных лиц по делам ГОЧС университета. В университете утверждены следующие нештатные аварийно-спасательные формирования: спасательная группа, звено связи, санитарный пост, пост РХБН, отделение пожаротушения, группа охраны общественного порядка, звено материально-технического обеспечения. Обучение личного состава НАФС планируется и проводится по 20 часовой рабочей программе обучения. В соответствии с организационно-методическими указаниями по подготовке населения в области ГО на кафедрах и факультетах университета созданы учебные группы, в которых занятия с сотрудниками университета проводятся по 14 часов программе. Студенты университета проходят ознакомительные практики в подразделениях и частях МЧС. Ежегодно с сотрудниками и студентами университета  проводятся командно-штабные учения, на которых отрабатываются вопросы эвакуации людей из учебных корпусов, отработки взаимодействия  НАСФ, тренировка руководящего состава действиям в условиях ЧС.
    Работа отдела ГО ЧС  строится в соответствии с Планом основных мероприятий университета в области ГО, предупреждения и ликвидации ЧС, обеспечения пожарной безопасности и безопасности людей на водных объектах. Штабом  ГО ЧС  университета отработаны  План Гражданской обороны и План действий по предупреждению и ликвидации ЧС.
    Для качественного решения  вопросов гражданской обороны  отдел организовал взаимодействие с ГУ МЧС России по Калужской области и Комитетом по организации защиты населения г.Калуги. Отдел регулярно обменивается информацией с отделами ГО ЧС других учебных заведений  г.Калуги.
    Охрана труда в университете строится на основе нормативно-правовых актов – Трудового кодекса, Постановлений Правительства РФ и приказов Федерального агентства по образованию устанавливающих требования к охране труда в учебных заведениях. Ведущий специалист по охране труда готовит предложения  ректору и совместно с администрацией, профсоюзной организацией  проводит  комплекс мероприятий  направленных на обеспечение жизни и здоровья студентов и сотрудников университета, соблюдение условий  охраны труда при проведении занятий, организует обучение вопросам безопасности труда. При проведение указанных мероприятий специалист взаимодействует с Центром гигиены и эпидемиологии по Калужской области, с Инспекцией по охране труда г.Калуги, медицинскими учреждениями города и учебным центром по охране труда. Специалистом по охране труда разработано и согласовано с профсоюзной организацией Типовое положение о службе охраны труда университета.